北大第一医院崔一民教授团队发现新的前列腺癌生物标志物

北大第一医院崔一民教授团队利用生物信息学与肿瘤类器官技术,首次发现SPP1在转移性去势抵抗型前列腺癌(mCRPC)中高表达,可能成为这一癌症类型的重要生物标志物及治疗靶点,对于早期发现、诊断、随访、治疗都有重要意义。这一发现于2019年9月18日发表于Frontiers in Oncology 学术期刊上(第一作者庞晓丛博士),科途医学为这一研究提供了前列腺癌类器官平台支持。

图1: 原文标题

前列腺癌是男性泌尿生殖系统最常见的恶性肿瘤,占男性恶性肿瘤死亡率第二位。由于肿瘤异质性强及基因突变的持续积累,为前列腺癌特异性标志物的发现提出了难度。近年来一些研究提示细胞外基质(ECM)可能是mCRPC潜在的肿瘤标志物而且在肿瘤的侵袭、转移、抗药性中发挥重要作用。

图2: 论文研究思路梗概
图3: 功能性富集生物信息学分析
图4: SPP1在不同类型前列腺癌类器官模型中的表达(IHC)

基于此,崔一民教授团队利用差异表达基因分析、重要信号通路分析、细胞成分表达等生物信息学方法,发现细胞外基质分子在mCRPC中高表达,随后,利用K-nearest neighbor、logisticregression、naive Bayes、random forest四种分类器进行确认,最后,利用科途医学建立的前列腺癌类器官进行验证,分别在RNA与蛋白质水平观察到SPP1在mCRPC中表达增强,为发现新的肿瘤标志物及治疗靶点提供了强有力的证据。

原文链接地址:

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fonc.2019.00924/full